Характеристика аллелофонда овец южной мясной породы с использованием микросателлитных маркеров

Цель: дать характеристику аллелофонда и генетического разнообразия овец южной мясной породы с использованием микросателлитов.

Материалы и методы. Биоматериалом послужили ушные выщипы 80 овец южной мясной породы, отобранные из «Племенного завода «Ладожский». Для сравнения использовали 20 овец восточно-фризской породы, 33 овцы породы дорсет и 63 овцы романовской породы. В качестве ДНК-маркеров были выбраны 9 микросателлитных локусов (INRA005, SPS113, INRA23, MAF65, McM527, OarCP49, HSC, OarAE129, MAF214). Вариабельность микросателлитов была анализирована с помощью генетического анализатора ABI3130x1 Genetic Analyzer. Результаты обрабатывались в программе GenAIEx 6.503, с помощью которой были рассчитаны основные показатели, характеризующие состояние аллелофонда и генетического разнообразия.

Результаты. Анализ популяционно-генетических параметров овец южной мясной породы показал, что показатели среднего числа аллелей на локус (Na) и эффективного числа аллелей на локус (Ne) превышают среднее по выборке на 1,72 и 0,58 аллелей соответственно. Ожидаемая гетерозиготность (He) составила 0,766, в то время как наблюдаемая гетерозиготность (Ho) – 0,741. Коэффициент инбридинга (Fis) был 0,03. Анализ главных компонент, проведенный для исследуемых пород в плоскостях первой и третьей главной компонент, кардинально не изменил характер пространственной кластеризации изучаемых групп овец. Анализ главных координат, выполненный на основе расчета попарных значений Fst, показал, что южная мясная порода находится в верхнем левом квадранте и обособленна от других пород. Значения показателя Fst указывают, что между породами южной мясной и дорсетом дифференциация умеренная (Fst=0,116), а между южной мясной и романовской – значительная генетическая (Fst=0,161).

Заключение. Анализ популяционно-генетических параметров овец южной мясной породы, в сравнении с восточно-фризской, дорсет и романовской пород показал, что, в целом по общему числу аллелей на локус и числа эффективных аллелей на локус, она характеризуется высоким уровнем генетического разнообразия. Наличие тенденции к дефициту гетерозигот объясняется, вероятно, ограниченностью популяции, представленной единственным реликтовым генофондным стадом в России.

1. Ерохин А. И. Овцеводство: [учебник для вузов] / А. И. Ерохин, С. А. Ерохин // Мин-во сел. хоз-ва РФ, Моск. с.-х. акад. им. К. А. Тимирязева. – М.: Изд-во МГУП. – 2004. – 478 с.

2. Зиновьева Н. А. Современные методы генетического контроля селекционных процессов и сертификация племенного материала в животноводстве: Учеб. пособие. / Н. А. Зиновьева, П. М. Кленовицкий, Е. А. Гладырь, А. А. Никишов // М.: РУДН. – 2008. – 329 с.

3. Денискова Т. Е. Динамика аллелофонда овец романовской породы на основании анализа микросателлитов / Т. Е. Денискова, А. Д. Соловьева, О. В. Костюнина, Н. А. Зиновьева // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2017. – № 3. – С. 5-6.

4. Петров С. Н. Разработка мультиплексной STR панели для контроля достоверности происхождения и характеристики генетического разнообразия коз / С. Н. Петров, В. Р. Харзинова, Е. А. Гладырь, Ч. С. Самбу-Хоо, Н. А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. – 2018. – № 11. – С. 60-63.

5. Зиновьева Н. А. Генетическая экспертиза сельскохозяйственных животных: применение тест-систем на основе микросателлитов / Н. А. Зиновьева, Е. А. Гладырь // Достижения науки и техники АПК. – 2011. – № 9. – С. 19-20.

6. Tautz D. Simple sequences are ubiquitous repetitive components of eukaryotic genomes / D. Tautz, M. Renz // Nucleic Acids Research. – 1984. – Vol. 12. – P. 4127-4138. DOI: 10.1093/nar/12.10.4127.

7. Гладырь Е. А. Характеристика аллелофонда овец юга России / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, С. С. Бурылова, М. И. Селионова, Л. Г. Моисейкина, Л. К. Эрнст, Г. Брем // Достижения науки и техники АПК. – 2012. – № 11. – С. 34-37.

8. Zinovieva N. A. Investigation of gene pool and genealogical links between sheep breeds of southern Russia by blood groups and DNA microsatellites / N. A. Zinovieva, M. I. Selionova, E. A. Gladyr, M. P. Petrovic, V. Caro Petrovic, D. Ruzic Muslic, M. M. Petrovic // Genetika. – 2015. – Vol. 47. – № 2. – P. 395-404. DOI: 10.2298/GENSR1502395Z.

9. Crispim B. Application of microsatellite markers for breeding and genetic conservation of herds of Pantaneiro sheep / B. Crispim; L. Seno; A. Egito; F. Vargas Junior; A. Grisolia // Electronic Journal of Biotechnology. – 2014. – № 17. – P. 317-321. DOI: 10.1016/j.ejbt.2014.09.007.

10. Денискова Т. Е. Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России / Т. Е. Денискова, М. И. Селионова, Е. А. Гладырь, А. В. Доцев, Г. Т. Бобрышова, О. В. Костюнина, Г. Брем, Н. А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. – 2016. – Т. 51. – № 6. – С. 801-810.

11. Kusza S. Microsatellite analysis to estimate genetic relationships among five bulgarian sheep breeds / S. Kusza, D. Dimov, I. Nagy, Z. Bõsze, A. Jávor, S. Kukovics // Genet Mol Biol. – 2010. – Vol. 33. – № 1. – P. 51-56. DOI: 10.1590/S1415-47572010005000003

12. Денискова Т. Е. Генетическая характеристика печорских овец с помощью микросателлитных маркеров / Т. Е. Денискова, Л. А. Канева, Е. А. Гладырь [и др.] // Достижения науки и техники АПК. – 2016. – Т. 30. – № 8. – С. 75-78.

13. Зиновьева Н. А. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве / Н. А. Зиновьева, А. Н. Попов, Л. К. Эрнст [и др.] // Дубровицы: ВИЖ. – 1998. – 47 с.

14. Peakall R. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update / R. Peakall, P. E. Smouse // Bioinformatics. – 2012. – Vol. 28. – P. 2537-2539.

15. Hartl D. L., Clark A. G. Principles of population genetics / D. L. Hartl, A. G. Clark // United Kingdom: Sunderland. – 1997. – Vol. 116. – P. 542.