Микросателлитные локусы, используемые для оценки генетического разнообразия вида Cervus Elaphus (обзор литературы)

Цель: обобщить научные публикации отечественных и зарубежных авторов, исследования которых включали применение STR-маркеров (short tandem repeat) в изучении генетического разнообразия вида Cervus elaphus (благородный олень) с последующим отбором высокополиморфных микросателлитных локусов.

Материалы и методы. В качестве материала для аналитической обзорной статьи взяты научные публикации отечественных и зарубежных авторов, связанные с изучением вида Cervus elaphus, а также официальные интернет ресурсы РФ. Научные публикации были изучены в открытых базах данных и библиотечных ресурсах: PubMed (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/), eLIBRARY.RU (http://elibrary.ru/defaultx.asp), CyberLeninka (https://cyberleninka.ru/). Поиск проводился по ключевым словам: Марал, микросателлиты, Cervus elaphus, STR-маркеры, генетическое разнообразие, мараловодство.

Результаты. Для благородного оленя успешно проведена амплификация 78 микросателлитных локусов, что подтверждено данными научных публикаций. Наиболее часто в работах встречались следующие локусы: BM4107, MM12, CSSM14, BM1818, CSSM19, CSSM22, CSPS115, HAUT14, ILSTS06, CSSM16, ETH225, INRA35. В своей таксономии благородный олень имеет множество подвидов, в связи с чем некоторые STR-маркеры могут отсутствовать у того или иного подвида. Для проведения микросателлитного анализа Cervus elaphus и его подвидов нами подобраны следующие высокополиморфные микросателлитные локусы: BL42, BMC1009, BM4107, BM4208, BM888, BM4513, ETH152, RT13, RT1, INRA11, MM12, CSSM14, BM757, BM1818, CSSM19, CSPS115, HAUT14, BMS745, C229, T107, ILSTS06, C01, T26, T108, T156, T172, T193, T501, T507, Cel_007, CER14, CSSM16, CSSM66, ETH225, INRA35, INRA005, LSCV085, OarFCB193, RME25, CSRM60.

1. Кузнецова М. В. Генетическая гетерогенность благородного оленя (Cervus elaphus L.) в Болгарии / М. В. Кузнецова, Г. Г. Марков, А. А. Данилкин // Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. – 2010. – № 4. – С. 84–87.

2. Чурбакова Н. А. Применение микросателлитного анализа в генетических исследованиях европейского зубра (Bison bonasus) / Н. А. Чурбакова, В. Р. Харзинова [и др.] // Генетика и разведение животных. – 2024. – № 1. – С. 5–17. doi: 10.31043/2410-2733-2024-1-5-17.

3. Цыб А. М. Исследования динамики генетической архитектуры свиней крупной белой породы на основе данных SNP-анализа / А. М. Цыб, В. Р. Харзинова [и др.] // Зоотехния. – 2025. – № 7. – С. 16–19. doi: 10.25708/ZT.2025.95.13.004.

4. Российская Федерация. Законы. Федер. закон о племенном животноводстве № 123-ФЗ : принят Государственной Думой 12 июля 1995 г.

5. Гуккина В. Б. Применение микросателлитных ДНК-маркеров при определении достоверности происхождения скота / В. Б. Гуккина // Исследования молодых ученых : материалы LXXII Межд. науч. конф. (г. Казань, декабрь 2023 г.). — Казань : Молодой ученый, 2023. — С. 21–25.

6. Харзинова В. Р. Применение микросателлитов в популяционно-генетических исследованиях северного оленя (Rangifer tarandus) (обзор) / В. Р. Харзинова, Н. А. Зиновьева // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. – 2024. – Т. 25. – № 4. – С. 525–537. doi: 10.30766/2072-9081.2024.25.4.525-537.

7. Chaturvedi A. Population genetic structure and phylogeography of cyprinid fish Labeo dero (Hamilton, 1822) inferred from allozyme and microsatellite DNA marker analysis / A. Chaturvedi, V. Mohindra et al. // Mol. Biol. Rep. – 2011. – V. 38. – P. 3513–3529. doi: 10.1007/s11033-010-0462-y.

8. Liu X. Isolation of New 40 Microsatellite Markers in Mandarin Fish (Siniperca chuatsi) / X. Liu, W. Luo, C. Zeng, W. Wang, Z. Gao // International journal of molecular sciences. – 2011. – V.12. – № 7. – P. 4180–4189. doi: 10.3390/ijms12074180.

9. Abdul-Muneer P. M. Application of Microsatellite Markers in Conservation Genetics and Fisheries Management: Recent Advances in Population Structure Analysis and Conservation Strategies // Genetics Research International. – 2014. – P. 1–11. doi: 10.1155/2014/691759.

10. Lei Y. Genome-wide characterization of microsatellite DNA in fishes: survey and analysis of their abundance and frequency in genome-specific regions / Y. Lei, Y. Zhou, M. Price et al. // BMC Genomics. – 2021. – V. 22. – № 1. doi: 10.1186/s12864-021-07752-6.

11. Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers / D. Tautz // Nucleic Acids Research. – 1989. – V. 17. – № 16. – P. 6463–6471.

12. Dobrovolskaya O. B. Development of new SSR markers for homoeologous WFZP gene loci based on the study of the structure and location of microsatellites in gene-rich regions of chromosomes 2AS, 2BS, and 2DS in bread wheat / O. B. Dobrovolskaya, C. Pont et al. // Vavilov J. of Genetics and Breeding. – 2015. – № 3. – P. 330–337. doi: 10.18699/VJ15.039.

13. Weber J. L. Informativeness of human (dC-dA)n * (dG-dT)n polymorphisms / J. L. Weber // Genomics. – 1990. – V. 7. — № 4. — P. 524—530. doi: 10.1016/0888-7543(90)90195-z.

14. Морузи И. В. Оценка генетического разнообразия внутрипородного типа породы Сарбоянский карп (Cyprinus carpio L.) / И. В. Морузи, Е. А. Елисеева, Н. Н. Разоков, М. С. Михайлова // Рыбное хозяйство. – 2025. – № 1. – С. 110—115. doi: 10.36038/0131-6184-2025-1-110-115.

15. Недашковский И. С. Популяционно-генетическая характеристика холмогорской породы крупного рогатого скота, разводимой в Архангельской области, на основе микросателлитных маркеров / И. С. Недашковский, А. Ф. Контэ [и др.] // Достижения науки и техники АПК. – 2025. – Т. 39. — № 1. – С. 57—63. doi: 10.53859/02352451_2025_39_1_57.

16. Харзинова В. Р. Характеристика генетической структуры аквакультурной и дикой популяций стерляди (Acipenser ruthenus Linnaeus, 1758) на основе анализа микросателлитов / В. Р. Харзинова, В. В. Волкова [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2024. – Т. 59. – № 4. – С. 666–679. doi: 10.15389/agrobiology.2024.4.666rus.

17. Никипелов В. И. Разработка мультилокусной STR-панели и оценка достоверности происхождения аквакультурной стерляди (Acipenser ruthenus) / В. И. Никипелов, В. Р. Харзинова [и др.] // Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса. – 2024. – № 3 (75). – С. 273—283. doi: 10.32786/2071-9485-2024-03-32.

18. Фоменко О. Ю. Полиморфные STR маркеры как инструмент популяционно-генетических исследований медоносных пчел Apis mellifera L. (обзор) / О. Ю. Фоменко, М. С. Форнара, А. В. Доцев // Сельскохозяйственная биология. – 2020. – Т. 55. – № 6. – С. 1090–1106. doi: 10.15389/agrobiology.2020.6.1090rus. EDN XWXRWK.

19. Решение об утверждении Положения о проведении молек. генет. экспертизы племенной продукции государств – членов Евр. экон. союза : утвр. Решением Коллегии Евразийской экон. комиссии от 2 июня 2020 г. № 74 // правовой портал: офиц. Сайт. URL: https://docs.eaeunion.org/documents/247/5175 (дата обращения 12.12.2024).

20. Mattioli S., Zachos F. E., Rossi L., Lister A. M., Corlatti L. (2022). Red Deer Cervus elaphus Linnaeus, 1758. In: Corlatti, L., Zachos, F.E. (eds) Terrestrial Cetartiodactyla. Handbook of the Mammals of Europe. Springer, Cham. doi: 10.1007/978-3-030-24475-0_19.

21. Володкина А. И. Экспериментальные данные по глубокой переработке пятнистого оленя / А. И. Володкина // Вестник Бурятской ГСХА имени В. Р. Филиппова. – 2018. – № 2. – С. 122–128.

22. Тишкова Е. В. Селекционно-генетические факторы, влияющие на продуктивные показатели маралов / Е. В. Тишкова // Вестник Бурятской ГСХА имени В. Р. Филиппова. – 2018. – № 2 – С. 75–81.

23. Луницын В. Г. Панты оленей (консервирование, оценка качества и биологические свойства) / В. Г. Луницын, А. А. Неприятель // ФГБНУ ВНИИПО. – Барнаул, 2016. – 35 с.

24. Луницын В. Г. Инновационное обеспечение пантового оленеводства Российской Федерации / В. Г. Луницын, А. А. Неприятель // ВНИИПО. – Барнаул, 2013. – 135 с.

25. Неприятель А. А. Способ ферментного гидролиза пантов маралов / А. А. Неприятель // Пищевая промышленность. – 2019. – № 4. – С. 72–74.

26. Министерство сельского хозяйства: официальный сайт. – Москва, 2023. — URL: https://mcx.gov.ru/press-service/regions/v-respublike-altay-zavershena-pantoreznaya-kampaniya-92887/ (дата обращения: 20.11.2024).

27. Данилкин А. А. Динамика населения диких копытных России : гипотезы, факторы, закономерности / А. А. Данилкин. – Москва : Товарищество научных изданий, КМК, 2009. – 310 с.

28. Tsyb A. M. The current state of maral breeding in Russia / A. M. Tsyb, G. V. Mkrtchyan // В сборнике: Global Issues Conf. 2025: Vet. Medicine, Biology, Biotechnology, Zootechnology, Pedagogical and Philological Sciences. Материалы III межд. науч.-практ. конф-ции. Москва, 2025. — С. 1034—1037.

29. Барышников Г. Ф. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Копытные. Часть 1. Непарнопалые и парнопалые (свиные, кабарговые, оленевые) / Г. Ф. Барышников, А. Н. Тихонов — СПб., 2009. — 164 с.

30. Kuehn R. Genetic diversity, gene flow and drift in Bavarian red deer populations (Cervus elaphus) / R. Kuehn, W. Schroeder et al. / Conserv. Genet. — 2003. – Vol. 4. – P. 157–166.

31. Polziehn R. O. Microsatellite analysis of North American wapiti (Cervus elaphus) populations / R. O. Polziehn, J. Hamr et al. // Mol Ecol. — 2000. — № 9(10). — № 1561–1576.

32. Feulner P. G. Mitochondrial DNA and microsatellite analyses of the genetic status of the presumed subspecies Cervus elaphus montanus (Carpathian red deer) / P. G. Feulner, W. Bielfeldt et al. // Heredity (Edinb). — 2004. — № 93 (3). – P. 299-306. doi: 10.1038/sj.hdy.6800504.

33. Edelhoff H. Genetic analysis of red deer (Cervus elaphus) administrative management units in a human-dominated landscape / H. Edelhoff, F. E. Zachos et al. // Conserv Genet. – 2020. – № 21. – № 261–276. doi: 10.1007/s10592-020-01248-8.

34. Golosova O. S. Genetic Diversity of the Eastern Subspecies of Red Deer (Cervus elaphus) in Russia Revealed by mtDNA and Microsatellite Polymorphism / O. S. Golosova, M. V. Kholodova, I. A. Volodin et al. // Biol Bull Rev. — 2023. – № 13. – P. 482–494. doi: 10.1134/S2079086423050110.

35. Zhang Q. Microsatellite variation in China’s Hainan Eld’s deer (Cervus eldi hainanus) and implications for their conservation / Q. Zhang, Z. G. Zeng, Y. J. Ji et al. // Conserv Genet. — 2008. – № 9. –P. 507–514. doi: 10.1007/s10592-007-9359-2.

36. Лубенникова М. В. Полиморфизм микросателлитных маркеров в шебалинской популяции маралов / М. В. Лубенникова, В. А. Афанасьев, К. А. Афанасьев // Вестник Ульяновской ГСХА. — 2024. — №1 (65). doi: 10.18286/1816-4501-2024-1-163-169.

37. Zachos F. E. Genetic Structure and Effective Population Sizes in European Red Deer (Cervus elaphus) at a Continental Scale: Insights from Microsatellite DNA / F. E. Zachos, A. C. Frantz et al.// J Hered. – 2016. – № 107(4). — № 318–326.

38. Frank K. Genetic traces of dispersal and admixture in red deer (Cervus elaphus) populations from the Carpathian Basin / K. Frank, K. Szepesi et al. // Eur J. Wildl Res. — 2022. — № 68. doi: 10.1007/s10344-022-01602-w.

39. Szabolcsi Z. Constructing STR multiplexes for individual identification of Hungarian red deer / Z. Szabolcsi, B. Egyed et al. // J. Forensic Sci. – 2014. № – 59(4). – P. 1090-1099. doi: 10.1111/1556-4029.12403.

40. Frank K. Mining the red deer genome (CerEla1.0) to develop X-and Y-chromosome-linked STR markers / K. Frank, N. A. Bana et al. // PLoS One. – 2020. – № 15(11):e0242506. doi: 10.1371/journal.pone.0242506.

41. Харзинова В. Р. Оценка генетического разнообразия и генетической структуры популяций эвенкийской породы северного оленя: анализ микросателлитов / В. Р. Харзинова, О. А. Кошкина // Межд. научно-исследовательский журнал. – 2025. – № 3(153). doi: 10.60797/IRJ.2025.153.100.

42. Харзинова В. Р. Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация кемеровской породы свиней на основе STR-анализа / В. Р. Харзинова, К. В. Жучаев, О. В. Костюнина, М. Л. Кочнева и др. // Достижения науки и техники АПК. – 2017. – Т. 31. – № 6. – С. 62–64.