Генетическая изменчивость фрагмента гена цитохромоксидаза мтДНК сибирского бурундука (Tamiassibiricus)
Аннотация
Сибирский бурундук распространен от Урала на востоке до Чукотки на западе. Сибирский бурундук является одним из типичнейших обитателей пойменных лесов Магаданской области. По материалам, собранным в июне 2016 г, первые исследована генетическая изменчивость цитохромоксидазы мтДНК сибирского бурундука, обитающего возле г. Магадана. Нуклеотидное разнообразие указанного гена в выборке из шести особей сибирского бурундука составило π=0,00451 ± 0,0004337, гаплотипическое разнообразие Hd=0,933 ± 0,0498. Обнаружено пять гаплотипов. По величинам генетической дифференциации все особи распределяются на две группировки, одна состоит из двух особей, другая из четырех. Имеющиеся в базе IBOL 18 нуклеотидных последовательностей у особей, отловленных в иных участках ареала, параметры генетического разнообразия имеют сходные величины (π=0,00326 ± 0,000167 и Hd = 0,843 ± 0,2357). Бурундуки, отловленные в северо-восточной части Китая, по величине генетической дифференциации представляют один кластер, в состав которого входит особь из Алтайского края. Магаданские бурундуки образуют отдельную группировку. Наиболее вероятная причина столь существенных генетических отличий - географическая изоляция магаданских бурундуков от животных из иных участков ареала.
Список литературы
1. Альбертс Б. Основы молекулярной биологии клетки / Б. Альбертс , Д.Брей , К.Хопкин , А. Джонсон , Дж.Льюис , М.Рэфф, К.Робертс , П.Уолтер // М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2015. - 768 с.
2. Шнеер В. С. ДНК-штрихкодирование видов животных и растений - способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия/ В.С.Шнеер В. С. // Журнал общей биологии. - 2009. - Т. 70. - №4. - С.296 - 315.
3. Ratnasingham S., Hebert P.D.N. BOLD: The barcode of life data system (www. barcodinglife.org) / S. Ratnasingham, P.D.N. Hebert // Molecular Ecology Notes. 2007. Doi:10.1111/j.1471-8286.2006.01678.x
4. Жизнь животных / Под ред. В.Е.Соколова. / М.: Просвещение, 1989. - Т.7. Млекопитающие. - 558 с.
5. Маниатис Т. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э.Фрич, Дж. Сэмбрук // М.: Мир, 1984. - 480 с.
6. Ivanova N.V.An inexpensive, automation-friendly protocol for recovering high-quality DNA / N.V. Ivanova, J.R. Dewaard , P.D.H. Hebert // Molecular Ecology Notes. 2006. - P. 1-5. (doi: 10.1111 /j.1471-8286. 2006.01748.x)
7. Tamura K. MEGA6: MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. / K. Tamura, G. Stecher, D. Peterson, A. Filipski, S. Kumar // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - 30. - P.2725 - 2729.
8. Librado P. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data / P. Librado, J. Rozas // Bioinformatics. 2- 009. - 25. - P.1451 - 1452.
9. Obolenskaya E.V. Diversity of Palearctic chipmunks (Tamias, Sciuridae) / E.V. Obolenskaya, Mu-Y. Lee, N.E. Dokuchaev, T. Oshida, Mi-S. Lee, H. Lee, A.A.Lissovsky // Mammalia. - 2009. - 73. - P.281-298.
10. Piaggio A.J. Molecular phylogeny of the Chipmunk inferred from mitochondrial cytochrome b and cytochrome oxidase II gene sequences / A.J. Piaggio, G.S.Spicer // Molecular Phylogenetics and Evolution. - 2001. - V. 20. 3. - P.335 - 350.
11. Piaggio A.J. Molecular phylogeny of the Chipmunk genus Tamias based on the mitochondrial cytochrome oxidase subunit II gene / A.J. Piaggio, G.S.Spicer // Journal of Mammalian Evolution. - 2000. - 7. 3. - P.147-166.
12. Lee Mu-Y. Mitochondrial cytochrome b sequence variations and population structure of Siberian Chipmunk (Tamias sibiricus) in Northeastern Asia and population structure in South Korea / Mu-Y. Lee, A.A. Lissovsky, S.K. Park, E.V. Obolenskaya, N.E.Dokuchaev, Y. Zhang, Y. Li, Y.J. Kim, I. Voloshina, A. Myslenko, T.Y. Choi, Mi-S. Min, H.Lee // Molecules and Cells. - 2008. - 26. - P. 566 - 575.
Рецензия
Для цитирования:
Аксютина С.А., Пустовойт С.П. Генетическая изменчивость фрагмента гена цитохромоксидаза мтДНК сибирского бурундука (Tamiassibiricus). Генетика и разведение животных. 2017;(3):73-77.
For citation:
Aksyutina S.A., Pustovoit S.P. Genetic variation of the fragment of the cytochrome oxidase mtDNA of the Siberian chipmunk (Tamias sibiricus). Genetics and breeding of animals. 2017;(3):73-77. (In Russ.)
Просмотров: 159
Послать статью по эл. почте 