Генетический мониторинг чистокровной верховой породы лошадей по локусам микросателлитов ДНК

В статье представлены результаты генетического мониторинга аллелофонда 8160 лошадей чистокровной верховой породы по 17-ти локусам микросателлитов ДНК, включая VHL20, HTG4, AHT4, HMS7, HTG6, AHT5, HMS6, ASB23, ASB2, HTG10, HTG7, HMS3, HMS2, ASB17, LEX3, HMS1, CA425. При проведении анализа все лошади были разделены на три группы в зависимости от года рождения: 1-я лошади- 1087-1999 гг.р., 2-я - 2000-2009 гг.р., 3-я - 2010-2017 гг.р., что соответствует интервалу смены поколений в коневодстве. У протестированных лошадей было идентифицировано 100 аллелей STR локусов, что свидетельствует о высокой генетической консолидации чистокровной верховой породы. Число аллелей в изученных локусах варьировало от 3 до 9, при колебаниях среднего значения Ae от 2,60 до 6,55 на локус. Сравнительный анализ генетической структуры чистокровной верховой породы в разные периоды времени показал, что на протяжении трех поколений с 1987 по 2017 годы основные генетико-популяционные характеристики менялись несущественно: Na (5,71-5,82), Ae (3,41-3,51), Ho (0,674-0,686). Самый высокий уровень генетического разнообразия отечественной популяции чистокровных верховых лошадей наблюдали в конце 90-х годов (I период), при наибольшей численности племенных маток в конных заводах и на племенных фермах. Увеличившийся импорт чистокровных верховых лошадей во второй период несколько увеличил вариабельность редких аллелей, но не внес существенных изменений в генетическую структуру породы. Проведенный мониторинг выявил тенденцию незначительного снижения генетического разнообразия в отечественной популяции чистокровных верховых лошадей в период 1987-2017 годов по всем базовым показателям (Na , Ае, Но). Нарушение генного равновесия (Fis=0,002) было зарегистрировано только во II-м периоде и было обусловлено дрейфом генов. Жеребцы-производители и матки отечественного происхождения имели типичный для породы спектр аллелей, но характеризовались несколько более низкой вариабельностью отдельных STR-локусов. Мониторинг генетико-популяционных параметров пород на базе микросателлитных локусов вполне адекватно отражает специфику селекционных процессов в популяциях и позволяет контролировать их генетическую пластичность, что особенно важно в коневодстве при чистокровной системе разведения.

генетический мониторинг, лошади, микросателлиты ДНК, популяционный анализ, чистокровная верховая порода

1. Алтухов, Ю. П. Генетические процессы в популяциях: 3-е изд. / Ю.П. Алтухов. - М.: Акадекмкнига, 2003. - 431с

2. Блохина Н. В. Мониторинг генофонда лошадей русской тяжеловозной породы по полиморфным системам крови / Н. В. Блохина, Л. П. Готлиб, Т. И. Орехова, Е. Г. Самандеева, М. А. Царева // Коневодство и кон. спорт. - 2018. - № 1. - С.29-30.

3. Блохина Н. В. Молекулярно-генетические особенности субпопуляций лошадей чистокровной верховой породы // Н. В. Блохина, Л. А. Храброва / Коневодство и кон. спорт. - 2012. - № 4. - С.13-15.

4. Вейр Б. С. Анализ генетических данных: Дискретные генетические признаки / Б. С. Вейр. - М.: Мир, 1995. - 400 с.

5. Калашников В. В. Полиморфизм микросателлитной ДНК у лошадей заводских и локальных пород / В. В. Калашников, Л. А. Храброва, А. М. Зайцев, М. А. Зайцева, Л. В. Калинкова // С.-х. биология. - 2011. - № 2. - С. 41-45.

6. Коновалова Г. В. Чистокровное коннозаводство в России и за рубежом // Г. В. Коновалова, А. В. Хлебосолова - М.: Аквариум-Принт, 2016. - 254 с.

7. Столповский Ю. А. Сохранение и управление генофондами сельскохозяйственных животных // Ю. А. Столповский / Аборигенные породы лошадей: их роль и место в коневодстве Российской Федерации: мат. I Всерос. науч.-практ. конференции. - Ижевск, 2016. - С. 131-138.

8. Храброва Л. А. Методические рекомендации по ведению генетического мониторинга местных пород лошадей / Л. А. Храброва, А. М. Зайцев, И. Б. Юрьева и др. - Дивово, 2005. - 50 с.

9. Храброва Л. А. Мониторинг генетической структуры пород в коневодстве / Л. А. Храброва // Доклады РАСХН. - 2008. - №3. - С.42-44.

10. Храброва Л. А. Влияние степени гомозиготности микросателлитных локусов на плодовитость и работоспособность кобыл чистокровной верховой породы // Л. А. Храброва, Н. В. Блохина / Коневодство и кон. спорт. - 2011. - № 4. - С.8-9.

11. Храброва Л. А. Инбридинг и степень гомозиготности микросателлитных локусов у лошадей (EQUUS CABALLUS) орловской рысистой породы / Л. А. Храброва, Н. В. Блохина, А. В. Устьянцева // С.-х. биология. - 2014. - №4. - С.35-41.

12. Putnova L. Genetic monitoring of horses in the Czech Republic: A large scale study with a focus on the Czech autochthonous breeds // L. Putnova, R. Stohl, I. Vrtkova / J. Anim. Breeding & Genetics. 2018. - Vol. 135. Issue 1. - P.73-83. doi: 10.1111/jbg.12313.

13. Seo J-H. Genetic diversity of Halla horses using microsatellite markers // J-H. Seo, K-D. Park, H.-R. Lee, H-S. Kong / J. Anim. Science & Technology. - 2016. - 58 (40). doi: 10.1186/s40781-016-0129-6.

14. The Second Report on the State of the World’s Animal Genetic Recourses for Food and Agriculture Organization of the United Nations. Rome, 2015.

15. Van de Goor, L. H. P. A proposal for standardization in forensic equine DNA typing: allele nomenclature for equine-specific STR loci / L.H.P. Van de Goor, W.A. van Haeringen // J. Animal Genetics. - 2010. - Vol. 41. - P. 122-127. doi: 10.1111/j.1365-2052.2009.01975.x.