

Популяционная структура микробных сообществ в рубце северных оленей Российской Арктики в зимний период по данным высокопроизводительного секвенирования
Аннотация
Об авторах
Л. А. ИльинаРоссия
Ильина Лариса Александровна — кандидат биологических наук, начальник молекулярно-генетической лаборатории
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
К. А. Лайшев
Россия
Лайшев Касим Анверович — доктор ветеринарных наук, профессор, член-корреспондент РАН
+7 (812) 476-79-14
196608, г. Санкт-Петербург — Пушкин, шоссе Подбельского, д. 7
Е. А. Йылдырым
Россия
Йылдырым Елена Александровна — кандидат биологических наук, биотехнолог
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
В. А. Филиппова
Россия
Филиппова Валентина Анатольевна — биотехнолог
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
Т. П. Дуняшев
Россия
Дуняшев Тимур Петрович — аспирант, биотехнолог
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
А. В. Дубровин
Россия
Дубровин Андрей Валерьевич — аспирант, биотехнолог
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
Д. В. Соболев
Россия
Соболев Дмитрий Валентинович — кандидат биологических наук, специалист
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
Н. И. Новикова
Россия
Новикова Наталья Ивановна — кандидат биологических наук, зам. директора
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
Г. Ю. Лаптев
Россия
Лаптев Георгий Юрьевич — доктор биологических наук, директор
192284, г. Санкт-Петербург, Загребский б., д. 19, корп. 1, кв. 13
А. А. Южаков
Россия
Южаков Александр Александрович — главный научный сотрудник, доктор сельскохозяйственных наук
196608, г. Санкт-Петербург — Пушкин, шоссе Подбельского, д. 7
Т. М. Романенко
Россия
Романенко Татьяна Михайловна — кандидат биологических наук, директор
166004, Ненецкий автономный округ, г. Нарьян-Мар, ул. Рыбников, 1А
Список литературы
1. Тараканов Б. В. Методы исследования микрофлоры пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных и птицы. М.: «Научный мир». - 2006. - 188 с.
2. Мухачев А.Д. Северное оленеводство в странах мира / А.Д. Мухачев, К.А. Лайшев // Норильск. - 2006.
3. Church D. C. Ruminant Animal: Digestive phisiology and nutrition. New Jersey: Prentice Hall, 1993.
4. Morgavi D. P. Rumen microbial (meta)genomics and its application to ruminant production / D. P. Morgavi, W. J. Kelly, P. H. Janssen, G. T. Attwood // Animal. - 2013. - № 7(1). - 184-201.
5. Orpin C. G. Seasonal changes in the ruminal microflora of the high-arctic Svalbard reindeer (Rangifer tarandus platyrhynchus) / C.G. Orpin, S.D. Mathiesen, Y. Greenwood, A.S. Blix // Appl. Environ. Microb. - 1985. - № 50(1). - 144-151.
6. Sundset M. A. Eubacterium rangiferina, a novel usnic acid-resistant bacterium from the reindeer rumen / M. A. Sundset, A. Kohn, S. D. Mathiesen, K. E. PrÊsteng // Naturwissenschaften. - 2008. - V. 95. - P. 741-749.
7. Salgado-Flores A., Hagen L.H., Ishaq S.L., Zamanzadeh M., Wright A-DG., Pope P.B. rumen and cecum microbiomes in Reindeer (Rangifer tarandus tarandus) are changed in response to a lichen diet and may affect enteric methane emissions. PLoS ONE. 2016. 11(5): e0155213.
8. Hungate R.E. The rumen and its microbes. Academic Press, NY, 1966.
9. Mathiesen S.D. Microbial ecology of the gastrointestinal tract in reindeer - changes through season. In: Microbial ecology of the growing animal / S. D. Mathiesen, R. I. Mackie, A. Aschfalk, E. Ringø, M. A. Sundset // Biology of the growing animals. Elsevier Press, Oxford. - 2005. - 73-100.
10. Sundset M. A. Novel rumen bacterial diversity in two geographically separated sub-species of reindeer / M. A. Sundset, K. E. PrÊsteng, I. K. O. Cann, S. D. Mathiesen, R. I. Mackie // Microbial. Ecol. - 2007. - V. 54. - P. 424-438.
11. Jami E. Composition and similarity of bovine rumen microbiota across individual animals / E. Jami, I. Mizrahi // PLoS ONE. - 2012. - V. 7 (3). - e33306.
12. Maniatis T., Frich Je., Sjembruk Dzh. Molecular cloning. M.: Mir, 1984. 480 s.
13. Pope P.B. Metagenomics of the Svalbard reindeer rumen microbiome reveals abundance of polysaccharide utilization loci. / P.B. Pope, A.K. Mackenzie, I. Gregor, W. Smith, M. A. Sundset, A. C. McHardy, M. Morrison, V. Eijsink // PLoS One. - 2012. - № 7. - e38571.
14. Zielińska S. New insights into the microbiota of the Svalbard Reindeer Rangifer tarandus platyrhynchus. / S. Zielińska, D. Kidawa, L. Stempniewicz, M. Łoś, J. M. Łoś. // Frontiers in Microbiology. - 2016. - № 7. - 170.
15. Nocek J. E. Bovine acidosis: implications on laminitis / J. E. Nocek // J. Dairy Sci. - 1997. - V. 80. - P. 1005-1028.
16. Henderson G. Rumen microbial community composition varies with diet and host, but a core microbiome is found across a wide geographical range. / G. Henderson, F. Cox, S. Ganesh, A. Jonker, W. Young, Global Rumen Census Collaborators, PH. Janssen. // Sci. Rep. - 2015. - № 5. - 14567.
Для цитирования:
Ильина Л.А., Лайшев К.А., Йылдырым Е.А., Филиппова В.А., Дуняшев Т.П., Дубровин А.В., Соболев Д.В., Новикова Н.И., Лаптев Г.Ю., Южаков А.А., Романенко Т.М. Популяционная структура микробных сообществ в рубце северных оленей Российской Арктики в зимний период по данным высокопроизводительного секвенирования. Генетика и разведение животных. 2019;(2):90-96. https://doi.org/10.31043/2410-2733-2019-2-90-97
For citation:
Ilina L., Layshev K., Yildirim E., Filippova V., Dunyashev T., Dubrovin A., Sobolev D., Novikova N., Laptev G., Yuzhakov A., Romanenko T. Population structure of microbial communities in the Russian Arctic reindeer's rumen in the winter period according to high-throughtput sequencing data. Genetics and breeding of animals. 2019;(2):90-96. (In Russ.) https://doi.org/10.31043/2410-2733-2019-2-90-97