Генетическая характеристика локальных пород овец Республики Таджикистан на основе применения STR-маркеров

Природные условия Республики Таджикистан способствовали активному развитию овцеводства. В связи с этим, было выведено большое количество выносливых и высокопродуктивных локальных пород. В настоящей работе представлено генетическое исследование овец гиссарской, таджикской и памирской тонкорунной пород с помощью микросателлитов. Полиморфизм 11 STR-локусов был изучен с использованием генетического анализатора. Статистическая обработка и визуализация данных были проведены в программах GenAIEx 6.503, PAST и Structure 2.3.4. Эффективное число аллелей варьировала от 2,81 у группы тонкорунных овец до 5,16 у группы таджикских овец. У таджикских, тонкорунных и гиссарских овец было обнаружено 5,73; 3,36 и 4,91 информативных аллелей на локус. Наибольший уровень генетического разнообразия был обнаружен у таджикских овец. Во всех группах был зафиксирован дефицит гетерозигот, который составил 8,2%; 10,2% и 18,2% у овец таджикской, гиссарской и памирской тонкорунной пород, соотвественно. На основе матрицы генетических дистанций по М.Нею по методу невзвешенного попарного среднего (UPGMA) было построено филогенетические древо. Гиссарские и таджикские овцы формировали кластер в виду общности происхожения. Значения показателя Fst свидетельствовали об умеренной дифференциации и составили 0,123 между овцами гиссарской и таджикской пород; 0,189 между овцами тонкорунной и таджиской пород и 0,239 между овцами гиссарской и тонкорунной пород. Для установления принадлежности особи к группе был проведен кластерный анализ в программе STRUCTURE. Все индивидуумы были отнесены к своим кластерам. Средние значения критерия членства в своем кластере были высокими во всех группах и составили Q_1/3= 0,967±0,014; Q_2/3=0,990±0,004 и Q_3/3=0,971±0,010 для овец таджикской, тонкорунной и гиссарской пород, соответственно. Таким образом, изучаемые группы овец являются четко обособленными друг от друга и характеризуются высокой внутрипородной консолидированностью. Исследования будут продолжены на большем поголовье.

домашняя овца, локальные породы, гиссарская порода, аллелофонд, генетическое разнообразие, идентификация

1. Рахимов Ш. Т. Породные ресурсы овец Таджикистана / Ш. Т. Рахимов, Н. А Раджабов // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2017. - № 1. - С. 30-33

2. Хайитов А. Х. Состояние и перспективы овцеводства в Таджикистане / А. Х. Хайитов, К. М. Курбонов // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2013. - № 2. - С. 112-113

3. Эрнст Л. К., Дмитриев Н. Г., Паронян И. А. (Ред.) Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах. СПб.: Изд-во ВНИИГРЖ, 1994

4. Николаев А. И. (Ред.) Овцеводство. 3-е изд., перераб. М.: Колос, 1964.

5. Peakall R. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update / R. Peakall, P. E. Smouse // Bioinformatics. - 2012. - № 28. - P. 2537-2539.

6. Weir B. S. Estimating F-Statistics for the analysis of population structure / B. S. Weir, C. C. Cockerham // Evolution. - 1984. - № 38(6). - P. 1358-1370.

7. Nei M. Genetic distance between populations / M. Nei // American Naturalist. - 1972. - № 106. - P. 283-392.

8. Hammer O. PAST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis /O. Hammer, D.A.T. Harper, P. D. Ryan // Palaeontologia Electronica. - 2001. - № 4(1). - P. 4-9.

9. Prichard J. K. Inference of population structure using multilocus genotype data / J. K. Prichard, M. Stephens, P. Donnelly // Genetics. - 2000. - № 155. - P. 945-959.